本书的内容，主要是利用一辆具有魔法的校车，在神奇女老师的带领下，载着小朋友，直接驶入海洋，过程惊险刺激，但也让小朋友得以亲自下海去欣赏这些五彩缤纷、形形色色的海洋生物。神奇校车先是驶过沙滩的“沙岸潮间带”，再进入“岩岸潮间带”，接着驶入“大陆架的浅海域”，再沿著大陆斜坡往下驶入黑暗无光的“深海生态系”，甚至到达科学家1977年才发现的“深海热泉生态系”，最后在上升返航途中再造访最美丽的“珊瑚礁生态系”。